Зал № 1. История крейсера «Аврора».
Зал № 2. Служба и быт личного состава Российского флота на рубеже XIX–XX вв. (на примере крейсера «Аврора»).
Зал № 3. История «Авроры» конца XIX — начала XX в.
Зал № 4. Первая мировая война, Октябрьская революция, Гражданская война, служба крейсера «Аврора» в межвоенный период.
Зал № 5. Великая Отечественная война. Крейсер «Аврора» в послевоенное время. Учебная база Ленинградского Нахимовского военно-морского училища. Ремонтные и реставрационные работы на крейсере «Аврора».
Зал № 6. «Аврора» — корабль-музей. Подарки крейсеру. Голографические копии моделей кораблей.
Зал № 7. Зал открытого хранения.
Зал № 8. История военно-морской медицины.
Зал № 9. Исторический хирургический пост.